Изучение пространственной структуры генома становится все более важным направлением в молекулярной биологии. Несмотря на активные исследования трехмерной организации ДНК у людей и сложных организмов, влияние архитектуры генома на регуляцию генов у бактерий оставалось в тени. Российские ученые из МГУ в сотрудничестве с коллегами впервые создали 3D-карту генома кишечной палочки с ультравысоким разрешением, что открывает новые возможности для науки и медицины. В ходе исследования был адаптирован метод Микро-С, который ранее использовался в основном для эукариот, что позволило отслеживать взаимодействие фрагментов ДНК на расстоянии всего 10 пар нуклеотидов. Это привело к открытию новых пространственных структур — «шпилек», которые играют ключевую роль в регуляции генов. Эксперименты с мутантами E. coli показали, что «шпильки» подавляют гены, полученные через горизонтальный перенос, а их взаимодействия помогают передавать генетическую информацию. По словам Сергея Разина, заведующего кафедрой молекулярной биологии МГУ, полученные результаты помогают понять механизмы передачи генов, в том числе тех, что отвечают за устойчивость к антибиотикам.