Когда вирус проникает в клетку, он нарушает ее нормальную деятельность. Ранее считалось, что клетки запускают процесс самоуничтожения в ответ на вирус, но новое исследование с участием биоинформатиков НИУ ВШЭ выявило, что причина в аномально длинных транскриптах, которые образуются у клеток. Результаты работы опубликованы в журнале Nature. Вирусы зачастую блокируют генетическую активность клеток, заставляя их производить вирусные белки, что делает клетки уязвимыми. Однако в некоторых случаях это приводит к активации защитных механизмов. Исследователи, работавшие в международной команде, заразили клетки вирусами герпеса и гриппа и использовали метод RIP-секвенирования для анализа. Выяснилось, что вирусные белки мешают завершению транскрипции, что приводит к образованию длинных молекул РНК, содержащих фрагменты «мусорной» ДНК. Эти молекулы распознаются белком ZBP1, который запускает клеточную гибель, что предотвращает размножение вируса. Ученые предполагают, что подобный механизм может быть активирован и при других вирусных инфекциях.